在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。数码世界急需一(🕕)批被选中的孩子来维护数码世(🎾)界和人类(🤞)世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后(🤙)成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并(🕝)肩作战，只有阿武和(📺)小光成为了新一代的领头人。被选(👣)中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配(⭕)音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽(🌑)、加布(🏭)兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码(☔)人的带领下，新的数码宝贝(🐨)和守护者们开始(🕜)了同邪恶势力的作战……