在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝(🤜)向人类的大门，而数码世(🌒)界的内部却没有太平多少时日，就又开始了(👰)纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世(🚟)界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人(🏣)。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏(🛤)树莉绪 配音）、火田伊织（夏(😟)树惠 配音）等人(😸)，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还(🕯)有新的数码宝贝参与(😶)。于是，在第一代数码人的带(🚢)领下，新的数码宝贝和守(🚟)护(🌩)者们开始了同邪恶势力的(🦐)作战……