在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝(🎶)向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始(🔃)了纷争。数码世界急需一批被(😧)选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已(🚫)先后成(🎋)为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起(🔲)并肩作战，只有阿武和(🈯)小(💝)光成为(🔶)了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（(🍐)木内玲子 配音(🍯)）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人(🚰)，和他们一同战斗的(🏇)除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……