在太一一行(🛄)人告(⛎)别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始(🍈)了纷争。数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、(🏌)素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和(🚴)时(🔆)间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有(➗)阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木(🌡)内玲子 配音(🏐)）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织(🍣)（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码(🐓)宝贝参与。于(😛)是，在第一代数码人的(🍷)带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……