工藤新一是全国(⛓)著名的高中生侦探(🌳)，在一次追查黑衣人(💘)犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(🗻)变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他(🍊)度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团(🕛)伙对他进行报复，新一决定隐姓(🐐)埋名，暗中追查他们，希望(🐘)能得到解药。一日，新一 的女友毛利(🎋)兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私(👐)家侦探，新一可(🖋)以籍着和他一起四出办(💯)案一(♊)起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣(🕯)战！