工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次(📭)追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮(🧘)助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复(⚫)，新一决定隐姓埋名，暗中追查他(🎹)们，希(👜)望(🤢)能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(🏟)寄居在了小兰家。小兰的父亲(✳)毛利小五郎是一名私家侦探，新一(🏒)可以籍着(🚰)和他一起(😘)四出办案(⛲)一起追查黑夜人(📼)的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！