工藤新一是全国著(🍖)名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(🌸)发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一(🔧)找到了经常帮助他(🎎)的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止(🏟)犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(🏋)望能得到解药(🏢)。一日，新一 的女友(🍻)毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见(🕐)的新一情急之下编造了自己名叫江户(🕢)川柯南，随后(🐫)柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(🏵)私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学(🌡)认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战(🕘)！