工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查(⏭)黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(👇)喂了神(⛎)奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠(🈯)博(💺)士，博士为他度(🍩)身打(💗)造不少(📣)间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复(⛰)，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(💘)药。一日，新一 的女友毛利(💤)兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(🙋)户川柯南，随后柯南寄居在了小兰(🥨)家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(📧)的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！