工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(📜)人犯罪团(🚂)伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的(🥁)药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不(🦐)少间谍武(🚐)器。为了防止(💗)犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(❇)到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰(🎾)撞见的新一情(🧡)急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(⛰)居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(🚶)下落(㊙)。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！